雜交捕獲是一種靶向目標富集方法,該方法通過針對目標基因設計捕獲探針,捕獲富集出高價值的目標基因序列進行測序,提高目標區域的測序深度。通過生物信息學分析,得到目標基因的變異信息,廣泛應用于遺傳病篩查和腫瘤檢測等領域。
百力格工業化合成平臺可以生產用于解決高通量測序、靶向測序等需求的高質量捕獲探針,也可以根據客戶需求提供定制化設計服務,捕獲效率更高。
捕獲探針panel設計

1. 質量驗證(腫瘤5基因KRAS、ALK、ROS1、EGFR、BRAF,與競品對照)
數量:Baits數量相差不大,主要是對困難區域
覆蓋度:BLG 覆蓋度:99.9%;競品覆蓋度:99.0%
質量:GC 分布相較于競品更集中;mask 指數分布相當



2. 設計策略與結果輸出
探針一般參數過濾:
gc、mask、Tm等
Blast映射過濾:
使用Blast 工具將所有baits 回貼至基因組,并且將比對結果進行歸類,根據回貼至基因組比對到的個數將探針分為green,yellow,black
設計策略:
1. 高特異性:只保留特意性高的green探針,去掉yellow和black探針(建議選擇)
2. 均衡特異性與覆蓋度:保留特意性高的green探針和特異性中等的yellow探針,去掉特異性差的black探針
panel調整策略:
某些區域的覆蓋度相對較低:增加該區域的探針含量/針對這部分區域額外設計探針加到原panel

3. 實驗驗證
raw data | Capture efficiency | Mean depth | dup% | Chimeras rate | fold_80 | 0.20*mean | 1X | 10X | 100X | |
腫瘤5基因-競品I設計 | 1.157 | 62.44% | 6275.15 | 36.47% | 2.55% | 1.31 | 98.11% | 99.70% | 99.34% | 99.07% |
腫瘤5基因-BLG v2設計 | 1.157 | 70.33% | 7205.494 | 33.99% | 2.39% | 1.24 | 98.26% | 100.00% | 99.82% | 99.13% |
腫瘤5基因:KRAS、ALK、ROS1、EGFR、BRAF(CDS區)
服務優勢
1. 高效率:采用高通量合成平臺結合自動化純化分裝,確保快速交付;
2. 保密性:信息管理系統保證對客戶序列信息的保密;
3. 定制化:根據客戶研究需求自由組合靶向基因,支持多樣本混合捕獲;
4. 精確合成:超過99.6%的化學耦合率,低頻突變并且每條探針都經過100%質譜檢測。
(常規合成堿基錯誤率在1/1,000左右,特殊合成可以提升到1/100,000以下的錯誤率。)
服務詳情
服務 | 堿基長度 | 規格 | 純化方式 | 交付標準 |
捕獲探針 | 80-120 nt | 500 pmol 定制 | 定制 | 單管/96孔板 干粉/液體 |
*捕獲探針產品按條收費




